隐藏大招的使用需要掌握特定的按键组合和操作时机。这些隐藏大招通常对应游戏中的隐藏角色或特殊状态角色，如暴走八神庵、疯狂莉安娜以及大蛇队成员。要触发这些隐藏大招，玩家需要在选人界面进行特定的按键输入，而非在战斗过程中直接发动。隐藏大招的威力往往远超普通必杀技，但使用条件也相对苛刻，需要玩家对游戏机制有较深理解。
暴走八神庵的隐藏大招需要在选人画面中按住START键，输入←→←→←→后同时按下轻拳和重拳（A+C）。这一操作成功后，八神庵的形象会发生变化，进入暴走状态。暴走状态的八神庵拥有更强的攻击力和特殊招式，但防御力会有所下降。疯狂莉安娜的激活方式类似，按住START键输入↑↓↑↓↑↓后同时按下轻脚和重脚（B+D），她的招式速度和连段能力将得到显著提升。
大蛇队成员的隐藏大招激活条件更为复杂。在选出疯狂莉安娜或暴走八神庵后，按住START键输入↑←↓→↑↓再同时按下轻脚和重拳（B+C），即可解锁大蛇队的三位BOSS角色。这些角色的招式判定范围大，伤害高，但收招硬直也相对较长。需这些隐藏角色的操作手感与常规角色差异较大，需要一定时间适应。
除了角色本身的隐藏状态，部分常规角色也拥有特殊的隐藏大招。例如草薙京的94版本可以通过按住START键选择来改变招式性能，虽然外观不变，但招式判定和连段方式会回归拳皇94的设定。这类隐藏变化虽然不如暴走状态明显，但在实战中也能带来不同的战术选择。掌握这些隐藏大招的关键在于准确记忆输入指令和把握按键时机。
